Ok, da irrst du tatsächlich.
Zum Einen ist die WaKü nicht per Molex am MB angeschlossen, sondern hängt an einem Lüfteranschluss. Der hat zwar auch zuweilen 4 Pins, aber ist ein anderer Anschlussstandard.
Molex sind die 4 Pin Anschlüsse am Netzteil, über die man "früher" HDDs unsw. angeschlossen hat.
Neben den 2 Pins zur Stromversorgung dient dabei ein weiterer zum übertragen des Tachosignals (Lüfterdrehzahl) und ein evtl. viertet vorhandener dient dem PWM Signal.
Es wird also ans das Mainboard lediglich das Tachosignal der Lüfter gesendet.
Irgendwelche anderen Sensoren gibt es da nicht.
Die Sensoren für die CPU Temperatur sitzen direkt in der CPU oder im CPU Sockel (heutzutage kann man in manchem BIOS auswählen, auf welcher Sensortemp die Lüftersteuerung basieren soll).